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发布于 2023-11-30 / 8810 阅读 / 0 评论 / 0 点赞

01.FastGWASR包安装

FastGWASR的安装

1.下载FastDownloader包

windows点击这里下载

mac和linux点击这里下载
点击链接下载FastDownloader包,这个包将是后续下载所有Fast系列包的基础

利用RStudio 面板,直接安装下载好的FastDownloader.zip包
根据图片安装这个包

2.安装FastGWASR包

在RStudio继续执行下面的安装代码

FastDownloader::install_pkg("FastAuthR")
FastDownloader::install_pkg("FastGWASR")

FastAuthR 用于权限认证

FastGWASR 用于获取云上GWAS的数据

3.进行激活

  1. 正常用户激活

    FastAuthR::register_fastgwasr("网页上的激活码")
    

    注意:如果出现以下报错,需要先执行下方代码,再重新激活
    微信截图_20240125104920.png

    install.packages("do")
    
  2. 团队学员激活
    注意 需要先到云上GWAS网页登录并绑定MendelR激活码

    FastAuthR::register_fastgwasr("同MendelR激活码")
    

继续往后看

FastGWASR的使用 | 阈上医学 (medicineitlab.com)


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